根据《民事诉讼法》第二百五十条第一款的规定，申请执行的期间为二年。申请执行时效的中止、中断，适用法律有关诉讼时效中止、中断的规定。故当事人仍需注意区分，虽然诉讼时效已经从两年更改为三年，但是申请执行的期间仍然为两年。那么两年的申请执行期间，又是从什么时候开始起算呢？

《民事诉讼法》第二百五十条第二款规定，申请执行的期间，从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从最后一期履行期限届满之日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。

而对于生效法律文书规定债务人负有不作为义务的，《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>执行程序若干问题的解释》（下称“《执行程序解释》”）第二十一条还规定，申请执行时效期间从债务人违反不作为义务之日起计算。

超过诉讼时效起诉的案件，很可能丧失胜诉权，那超过申请执行时效才申请执行的案件，又有什么后果呢？

按照《民诉法解释》第四百八十一条第一款规定，申请执行人超过申请执行时效期间向人民法院申请强制执行的，人民法院应予受理。被执行人对申请执行时效期间提出异议，人民法院经审查异议成立的，裁定不予执行。

换言之，超过申请执行时效和超过诉讼时效的案件一样，法院不会对超过申请执行时效进行释明，也不会主动适用申请执行时效的规定，只要申请执行人提出申请，法院仍然会进行立案，但如被执行人提出异议，法院审核异议成立的，就会裁定不予执行。